Один только старый дом стоял в глубине двора (,) полинявший местами (,) с поросшим травой (3) крыльцом, с тяжёлыми дверьми (,) замкнутыми тяжёлыми же задвижками.

РЕШЕНИЕ: 

Необходимо найти все причастия (причастные обороты), деепричастия (деепричастные обороты) и определяемые слова (те, от которых обороты зависят). Для причастия (ПО) это обычно существительное. Для деепричастия (ДО) – глагол.

«Полинявший» – причастие. «Полинявший местами» – причастный оборот. ПО обособляются, когда стоят после определяемого слова. Определяемое слово – «дом». ПО стоит после него, значит, на месте цифр 1 и 2 должны стоять запятые.

«Поросшим» – это причастие. «Поросшим травой» – причастный оборот. ПО обособляются, когда стоят после определяемого слова. Определяемое слово «крыльцо». ПО стоит перед ним, поэтому запятая на месте цифры 3 не нужна.

«Замкнутыми» – причастие. «Замкнутыми тяжёлыми же задвижками» – причастный оборот. ПО обособляются, когда стоят после определяемого слова. Определяемое слово – «двери». ПО стоит после него, значит, на месте цифры 4 должна стоять запятая.